Antecedentes y objetivos: La diabetes mellitus tipo 2 (DM2) es una enfermedad multifactorial, altamente prevalente, y poligénica. Sin embargo, los estudios genéticos no han contemplado el impacto que la ancestría puede tener sobre su perfil de riesgo. El objetivo de este trabajo es generar un perfil de riesgo genético estratificado por la ancestría de poblaciones colombianas.
Métodos: Extrajimos todos los SNPs (n=2,618) asociados significativamente a DM2 del GWAS Catalog. Comparamos sus frecuencias alélicas entre poblaciones predominantemente africanas (Palenque/PLQ, Chocó/CHG) y europeas (PPE) (Antioquia/ATQCES, ATQPGC, CLM) utilizando análisis de componentes principales (PCA) y correlación.
Resultados: En el PCA, el primer componente (62.2% de varianza) segregó significativamente a CHG (PC1:21.52) del resto de poblaciones. El segundo componente (36.1%) aisló a PLQ en el extremo negativo (PC2:-13.45). Las correlaciones de Spearman corroboraron el aislamiento genético de PLQ, mostrando una baja similitud del perfil de riesgo con las PPE (r =0.71) con las PPE. Reportamos 270 SNPs predominantes en PLQ y 117 en PPE, resaltando rs543786825-T (OR:3.15) y rs551513405-A (OR:3.05). La mayoría de asociaciones se encontraban en los cromosomas 3 y 10-12, y relacionados a los genes TCF7L2 y KCNQ1. De los 13,038,347 de individuos estudiados, el 41% eran europeos y solo el 11% de ancestría africana.
Conclusiones: PLQ tiene un perfil de riesgo genético distinto al de las PPE. Sin embargo, su ancestría predominante ha sido sub-representada en la investigación genética de la DM2, implicando que todavía pueden haber SNPs ancestría específicos no descritos.
